Správní území města Strážnice bylo zasaženo několika významnými povodněmi. Největší povodeň zasáhla zájmové území v roce 1997. Na území došlo k mnoha dalším povodním v letech 2006, 2010 a 2017. Všechny povodně zasáhly především nezastavěné území města vyjma bleskové povodně v r. 2017
Rok 1997 Povodně velkého rozsahu na celé Moravě v červenci. Ve správním území města Strážnice byla rozvodněná řeka Morava. Byl vyhlášen třetí stupeň povodňové aktivity. Po protržení náspu železniční tratě Bzenec-Veselí, který zadržoval velké jezero vody, vznikla povodňová vlna, která byla ve Strážnici zaznamenána 14. července. Došlo k zatopení areálu hřiště, koupaliště, autokempu, soukromých firem a mostu přes vodní tok Velička. Bylo zatopeno několik sklepů rodinných domů v ulicích Rybářská, Bratrská, Nová a Staré město.
Rok 2006 Zaplaveno rozsáhlé nezastavěné území města Strážnice (3.SPA). Povodeň na Veličce (3.SPA) měla mimořádně rychlý průběh. Škody způsobeny na zemědělské půdě.
Rok 2010 Povodně způsobené velmi intenzivními srážky trvalého charakteru (3.SPA). Rozlitá Morava zůstala v inundačním území. Za inundační hrází nastoupala do polí pouze spodní voda. Rozvodněná byla rovněž Velička (3.SPA), která se v zastavěné části udržela v korytě.
Rok 2017 Přívalová povodeň zasáhla město Strážnici 13. května. Bylo zatopeno několik sklepů rodinných domů, firem a došlo k zaplavení komunikací erozním materiálem. Jednalo se o východní část města, především ulice Dúbrava, Jiráskova, Polní, U Vlečky, T. Zrníka, Hraničky, Radějovská, Třešňová, Jiřího z Poděbrad, Školní a Skalická.
